Команда ИР адаптера "Запомнить для сравнения" запоминает для сравнения выделенный или весь текст из текущего текстового поля и выводит уведомление о количестве запомненных строк текста. При каждом втором вызове открывает немодальное сравнение первого текста со вторым (с учетом программного языка на платформе 1С 8.3.15+) в главном окне приложения ИР.
Буфер сравнения хранится в памяти приложения ИР. Поэтому команда работает только в рамках одной базы.
Для сравнения между разными базами можно использовать варианты:
ИР Свернуть дерево кроме текущей
ИР Автодополнение / контекстная подсказка